Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01545Q5VT33 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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LINC01545Q5VT33 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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