Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms