Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TDRD12Q587J7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms