Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC14Q49A88 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms