Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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