Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDK4Q16654 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms