Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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DDB1Q16531 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DDB1Q16531 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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