Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PRR4Q16378 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PRR4Q16378 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PRR4Q16378 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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PRR4Q16378 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PRR4Q16378 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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