Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS72Q15906 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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