Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
GRK1Q15835 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
GRK1Q15835 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms