Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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