Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TWIST1Q15672 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms