Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms