Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms