Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MTMR3Q13615 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MTMR3Q13615 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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