Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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