Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NME3Q13232 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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NME3Q13232 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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