Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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CALCOCO2Q13137 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CALCOCO2Q13137 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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