Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
COX10Q12887 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms