Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms