Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRP1Q07954 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms