Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms