Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPAQ06546 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms