Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CD164Q04900 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms