Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUCB1Q02818 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms