Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms