Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms