Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms