Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD3P84022 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms