Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMF1P82094 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMF1P82094 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms