Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFI35P80217 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFI35P80217 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms