Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA2P54646 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms