Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF2A1P52655 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms