Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMARCA2P51531 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms