Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSRP3P50461 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms