Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK1EP49674 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK1EP49674 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms