Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRCC3P46736 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms