Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP5P45974 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP5P45974 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
USP5P45974 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP5P45974 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP5P45974 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP5P45974 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP5P45974 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP5P45974 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
USP5P45974 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP5P45974 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP5P45974 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP5P45974 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP5P45974 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP5P45974 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP5P45974 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP5P45974 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms