Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms