Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PBX2P40425 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PBX2P40425 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms