Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms