Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5F1P24539 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5F1P24539 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms