Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KB1P23443 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms