Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM21P19474 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms