Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PDE6GP18545 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PDE6GP18545 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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