Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFAPP14136 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFAPP14136 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFAPP14136 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFAPP14136 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFAPP14136 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFAPP14136 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFAPP14136 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFAPP14136 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFAPP14136 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFAPP14136 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFAPP14136 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFAPP14136 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms