Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DMDP11532 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DMDP11532 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DMDP11532 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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