Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms