Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNX4O95219 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX4O95219 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX4O95219 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX4O95219 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNX4O95219 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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