Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF10O60809 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms